martes, 28 de febrero de 2012




INSTITUTO TECNOLOGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO



UNIDAD  3

ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENETICO





QUE PRESENTA:



ELVIRA  ROJAS  NAVA.

09930053







LICENCIATURA EN BIOLOGIA









CIUDAD ALTAMIRANO GRO. MEXICO,   FEBRERO DEL 2012







INTRODUCCIÓN

El material genético se emplea para guardar la información genética de una forma de vida orgánica. Para todos los organismos conocidos actualmente, el material genético es casi exclusivamente ácido desoxirribonucleico (ADN o DNA). Algunos virus usan ácido ribonucleico (ARN o RNA) como su material genético.

El material genético corresponde a una molécula que debe cumplir con tres propiedades: Capacidad de auto duplicación. Capacidad de almacenar información. Capacidad de variar la información. De las moléculas orgánicas que forman parte de los seres vivos (proteínas, glúcidos, lípidos y los ácidos nucleicos) la única que cumple las propiedades corresponde a los ácidos nucleicos.

El material genético se compacta en un área discreta de la célula formando los cromosomas. Éstos se encuentran en los virus, células procariotas, en el núcleo de células eucariotas y en cloroplastos y mitocondrias.



OBJETIVOS.

*      Comprender la forma en que está organizado el genoma de los organismos para entender su funcionamiento

*      Relacionar los distintos grados de empaquetamiento con las distintas etapas del ciclo celular.

*      Discutir las distintas maneras en que el ADN se organiza en cromosomas, incluyendo virus, bacterias y eucariotas









MATERIAL GENÉTICO EN BACTERIAS.

El cromosoma bacteriano se compacta formando una estructura llamada NUCLEOIDE. Es un cromosoma circular y bicatenario formado por ADN, ARN y proteínas básicas. Se produce una interacción entre el ADN cargado positivamente y las proteínas cargadas negativamente.

Junto al cromosoma se pueden encontrar plásmidos.



Las células que portan el factor F se conocen como F+ y las que no son F-. Las propiedades del factor F son las siguientes:

1. El factor F puede replicarse por lo que se mantiene en una población celular que se esté dividiendo.

2. Las células F+ producen pili que son túbulos proteicos que les permiten ponerse en contacto y adherirse a otras células.

3. Las células F+ pueden transmitir el factor F a células F- pero no a células F+. Siempre permanece una copia en la célula donante.

4. Ocasionalmente el factor F se integra en el cromosoma de la célula hospedadora.

Cuando esto ocurre, al transferirse el factor F, se transfiere también el ADN de la célula hospedadora, así se transfieren marcadores cromosómicos de la célula hospedadora a la célula nueva.

En principio, el factor F se integra en una pequeña proporción de células con lo que éstas células puede transferir marcadores cromosómicos a una nueva estirpe. Se pueden aislar las células con el factor F integrado en el cromosoma y cultivar especies puras derivadas de estas células. En estas estirpes, cada célula transmite marcadores cromosómicos durante la transferencia de F, de modo que la frecuencia de recombinantes es mucho mayor que en las células de la población original donde el factor F está en el citoplasma. Por esta razón a las estirpes con el factor F integrado se les llama Hfr (high frequency of recombination). La integración del factor F en E. coli se produce entre regiones homólogas del factor F y de su ADN.

PLÁSMIDOS

Son elementos extracromosómicos, moléculas pequeñas de ADN que están libres en el citoplasma. Los plásmidos llevan información genética y se replican dando lugar a nuevos plásmidos que se incorporan a las células hijas en la división celular. Algunos de ellos pueden integrarse en el cromosoma. Los plásmidos pueden tener funciones diversas y algunos de ellos son plásmidos R, Col, y el factor F cuando está en estasdo citoplásmico.

SUPERENROLLAMIENTOS

Los superenrollamientos se producen en los plásmidos, los ADN circulares y los ADN lineales que no pueden girar sobre uno de sus extremos. Existen dos tipos de superenrollamientos, los positivos y los negativos. Los positivos enrollan más el dúplex, con lo que las bases están más apretadas (hay más pares de bases por vuelta)(el dúplex se gira a la derecha). Los negativos desenrollan más el dúplex, las bases están por tanto más separadas (hay menos pares de bases por vuelta)(el dúplex se gira a la izquierda).

Dos formas de un ADN circular que difieran únicamente en una propiedad topológica (como es que esté más o menos superenrollado) son topoisómeros ya que no cambia su composición en pares de bases, etc.

Esto tiene mucho que ver sobre todo para el empaquetamiento del ADN en eucariotas y también en procariotas.

DIFERENCIAS ENTRE EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS.

La diferencia fundamental está en la cantidad de ADN que es inferior en procariotas que en eucariotas como por ejemplo: en E. coli el ADN mide 1.3 mm y tiene 4.2 Mb mientras que una célula humana tiene 1.8 mm y 6000 Mb pero si hay 10 elevado a 13 células, el ADN humano mide 2 x 10E13 m.

En la siguiente tabla se muestran las diferencias más importantes:


EL CROMOSOMA EUCARIÓTICO.

Los cromosomas se encuentran en el núcleo celular separados del resto de la célula por la membrana nuclear. Un cromosoma tiene tres partes fundamentales: centrómero, telómero y los brazos.

Los cromosomas eucarióticos están la mayor parte del ciclo celular como una sola cromátida y como dos cuando se replica. La replicación del ADN es semiconservativa, esto se demostró en un experimento en el que se marcó con tritio una cromátida. Entonces se procedió a replicar esta cromátida en presencia de tritio y se obtuvo un cromosoma de dos cromátidas marcadas. Se hizo volver a replicarse, esta vez sin presencia de tritio y se obtuvieron cuatro cromátidas formando dos cromosomas. Cada cromosoma tenía una molécula marcada y la otra no con lo que en la replicación se conservaba para el nuevo cromosoma una de las cromátidas parentales.

ORGANIZACIÓN DEL CROMOSOMA EUCARIÓTICO

En células eucarióticas que no se hayan sometidas a división celular el cromosoma recibe el nombre de cromatina. La cromatina consiste en fibras que contienen proteínas, ADN (en cantidades muy parecidas) y una pequeña porción de ARN. Las proteínas que se asocian al ADN son básicas y se llaman histonas. Las histonas que participan son H1, H2A, H2B, H3 y H4 y su porcentaje de aminoácidos básicos y características son:


Ahora pondré por orden de empaquetamiento los diferentes niveles, desde el primero hasta el último Sucesivamente.

PRIMER NIVEL: NUCLEOSOMA

Esta estructura vista al microscopio se ve como si fuera un collar de perlas del que las cuentas son los nucleosomas.

El nucleosoma está formado por un octámero de histonas en el que hay dos subunidades de las histonas H2A, H2B, H3 y H4. Alrededor de este octámero se arrolla el ADN con dos vueltas. El espaciamento entre las cuentas está formado por ADN que se llama ADN puente. El nucleosoma mide 6 nm. Los nucleosomas se vuelven a organizar con la ayuda de la histona H1 habiendo una por cada nucleosoma.

SEGUNDO NIVEL: FIBRA DE 30 nm.

El nucleosoma que contiene H1 se pliega en una conformación en zigzag cuya apariencia sugiere que los nucleosomas interaccionan mediante contactos entre sus moléculas H1. Esta fibra que se forma tiene 30 nm de espesor, en el que se aprecian los nucleosomas. Las histonas H1 se disponen de manera que forman el eje central sobre el que se arrollan los nucleosomas. Por cada vuelta de la espiral que forma esta fibra hay seis nucleosomas. A este arrollamiento de los cromosomas sobre sí mismos se le llama solenoide.

TERCER NIVEL: FIBRA DE 200 nm.

Si eliminamos las histonas del cromosoma en metafase mitótica se puede ver que los cromosomas tienen un esqueleto central densamente teñido. Desde este esqueleto se proyectan lazos de ADN que comienzan y acaban en el esqueleto. Este esqueleto central está compuesto por la enzima toposiomerasa II (enlazan o desenlazan nudos o lazos en una cadena) en el que parece haber regiones especiales llamadas regiones de unión al esqueleto o SAR.

CUARTO NIVEL: CROMOSOMA

Se produce por el arrollamiento de la fibra de 200 nm sobre sí misma.



MATERIAL GENÉTICO EN VIRUS

La mayoría de los virus, presenta un sólo cromosoma formado por ADN o ARN que puede ser unicatenario, bicatenario, lineal o circular.

Los fagos de bacterias están rodeados por una cubierta de proteínas e inyectan su cromosoma al interior de la bacteria. El cromosoma del virus puede seguir dos rutas dependiendo del tipo de fago que sea:

·         FAGO VIRULENTO: siempre sigue la ruta lítica.

·         FAGO TEMPERADO: pueden seguir la ruta lítica pero normalmente siguen la ruta lisogénica según la cual el fago está en la célula como un profago.

CICLO LÍTICO

1.    1º Un fago se adhiere a la célula hospedadora e inyecta su ácido nucleico en la célula.

2.    2º Con la "maquinaria" de la bacteria, el fago replica su material genético y sintetiza sus proteínas mientras que el cromosoma del huésped se degrada.

3.    3º Los fagos se ensamblan en el interior de la célula huésped.

4.    4º La bacteria se lisa y los fagos quedan libres.

CICLO LISOGÉNICO

1.    El fago se adhiere a la célula hospedadora e inyecta su material genético.

2.    La célula, tiene, en estos momentos, dos ADN circulares (uno de ellos del fago).

3.    El ADN del fago se integra en el cromosoma de la célula huésped.

4.    Se produce entonces la lisogenia: la bacteria es portadora del ADN del fago pero es inmune a su acción lítica aunque sí que pueden infectar a otras bacterias no resistentes a estos virus y provocar su lisis.

ENSAMBLAJE DE LOS VIRUS

1.    Procabeza I: está formada por el núcleo protéico de lo que será la cabeza.

2.    Procabeza II: la cabeza está formada pero vacía.

3.    Comienza el empaquetamiento del ADN que va entrando a la célula conforme está empaquetándosse.

4.    La cabeza se expande cuando ya está parcialmente llena de ADN y se hace un poco más grande.

5.    La cabeza está completamente rellena y preparada para el enganche de la cola.

La cola se engancha y el virus está completamente maduro







BIBLIOGRAFIA





*      www.slideshare.net/.../material-gentico-4286509

*      biologiacelularb.com.ar/joomlaespanol/images/.../unidad%204.4ii.pd








lunes, 27 de febrero de 2012

TRANSPOSONES




                                                                                                                     


INSTITUTO TECNOLOGICO

      DE CD. ALTAMIRANO GRO

                    



LIC: BIOLOGIA





MATERIA:                                                                                                                                                                                                                                                      BIOLOGIA   MOLECULAR.







PRESENTA:

ELVIRA ROJAS NAVA.





VI  SEMESTRE



PROFESOR:

FRANCISCO  JAVIER  PUCHE ACOSTA.






CD.ALTAMIRANO, GRO.                   27/ 02/2012



TRANSPOSONES

Transposon. Secuencia de DNA que puede moverse de un lugar a otro del cromosoma, insertar copias adicionales de ella misma en otros puntos o pasar de un cromosoma a otro. Tramo de DNA que puede incorporarse en otras moléculas de DNA en lugares donde no hay homología de secuencia, sino a través de una proteína específica denominada transposasa. Tienen un tamaño entre 1 y 40 kb. Codifican todas las enzimas necesarias para su inserción. Pueden desplazarse dentro de un cromosoma o entre cromosomas. Elemento genético móvil que puede moverse de una localización genómica a otra, gracias a la presencia de secuencias repetidas cortas que lo flanquean y que es capaz de replicar e insertar una copia en un lugar nuevo en el genoma.















En los procariotas, los elementos genéticos transponibles aparecen tanto en el cromosoma como en los plásmidos. En general, estos elementos están flanqueados por repeticiones invertidas y tienen la capacidad de transponerse de un lugar a otro dentro del cromosoma, dentro de los plásmidos y también entre los plásmidos y el cromosoma.

 Bacterias se han clasificado en dos clases, denominadas I y II

 Clase I fueron divididos en dos subclases:

v  las secuencias de inserción (IS) tienen un tamaño aproximado de 0,3 kpb y en ambos extremos presentan dos secuencias denominadas ITR (Inverted Terminal Repeat). Además, contienen un gen que codifica para una transposasa, la enzima que interviene en el mecanismo de transposición.



v  los transposones compuestos. tienen un tamaño que oscila entre 2,5 y 10 kpb, presentando en ambos extremos dos elementos IS y, además, contienen genes que codifican para proteínas que les confieren resistencia a diferentes antibióticos.

v   clase II comprenden la familia del transposón 3 (Tn3), con un tamaño de aproximadamente 5 kpb. Estos poseen en los extremos secuencias ITR y, además de contener un gen que codifica para la transposasa, poseen otro gen codificante para la enzima resolvasa (res), que lleva a cabo la resolución del cointegrado durante la transposición (cataliza la deconcatenación del DNA en sitios específicos llamados sitios res).  




BIBLIOGRAFIA

www.biologia.edu.ar/adn/adntema3.htm


mbelaich.blog.unq.edu.ar/modules/docmanager/get_file.php?

bioinformatica.uab.es/.../treballs00.../transposones_procarióticos.htm

unidad 3








INSTITUTO TECNOLOGICO

 DE CD. ALTAMIRANO GRO
                    



LIC: BIOLOGIA





       MATERIA:                                                                                                                                                                                                                                                      BIOLOGIA MOLECULAR.







PRESENTA:

ELVIRA ROJAS NAVA.





VI  SEMESTRE



PROFESOR:

FRANCISCO  JAVIER  PUCHE ACOSTA.






CD.ALTAMIRANO, GRO.                   27/ 02/2012




UNIDAD  3:   ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL  GENETICO.



El ADN en las bacterias se les llama nucleoide y el ADN plasmitico. Las bacterias son microorganismos que no tienen núcleo es por eso que se les llama procariontes. Las bacterias tienen 5 MB y las proteínas que hacen que el material genético se enrolle en las bacterias se llaman HU o HNS.  

El ADN  de los plásmidos es extra cromosómico y le sirve para hacerse inmunerables a antibióticos puede ser circular o lineal. Tienen pocos genes de 5KB y sí son mas grandes se rompen.

  Las bacterias (procariontes) como ya se sabe tiene dos tipos de ADN los cuales  se describirán.


   
ADN cromosómico: 5MB


Es circular o lineal

Espacio intergenico pequeño

Se organiza en el nucleoide

Se enrollan por HU

ADN plasmidico: circular o lineal

Tiene genes ventajosos

Obligados a vivir dentro de la bacteria

Genes muy agrupados

Son resistentes a antibióticos.

1. Moléculas extracromosómicas de DNA, circulares o lineales, que coexisten con el genoma de la bacteria.

2.-. Portadores de genes no presentes en el cromosoma bacteriano p.e. genes de resistencia a antibióticos.

3.-. Un mismo plásmido puede hallarse en especies distintas de bacterias.

4. Por todo ello no suele considerárseles como parte del genoma bacteriano propiamente dicho, aunque en algunos casos ésto sea muy discutible.



BACTERIOFAGOS.

Son virus que atacan a bacterias, no crecen, no tienen metabolismo ni enzimas. Son parásitos obligados de las células vivas. ADN doble cadena.

El bacteriófagos T4 es un virus complejo con una cabeza icosaedrica y una cola en la que hay una placa basal y fibras de fijación.  El genoma se compone de una molécula de ADN bicatenario que se encuentra fusionado.


 

3.2 ORGANISMOS EUCARIOTICOS.

El ADN de los organismos eucarioticos es  lineal y tiene  varios cromosomas.



Diferencias de los organismos eucariontes con los procariontes.

Procariontes                                  eucariontes

No tienen núcleo                             si tienen núcleo.

1 cromosoma                                   varios cromosomas

ADN   lineal o circular                      ADN lineal

Bacterias  haploides                        diploides  plantas y animales



Poliploides: son los organismos que presentan más de dos n, ejemplo el plátano que contiene 3n y se les llama triploide.

Las histonas son las proteínas que envuelven el ADN y son (H2A, H2B, H3 Y H4)

El ADN tiene un diámetro de 2 nm

Hay cuatro niveles de empaquetamiento.

1.- enrollamiento se le llama solenoide y tiene un diámetro de 30 nm

2.- de da un superenrollamiento

3.-  el ADN se ancla a un esqueleto que le dará soporte para su enrollamiento

4.- el solenoide sigue formándose hasta empaque





Partes de un ADN bacteriano

Genes

ADN intergenico

Partes de un ADN en organismo eucariotico

Exones

Intrones

ADN intergenico

Regiones promotoras

Una gran diferencia de los procariontes con los eucariontes es que en su ADN las bacterias no tienen intrones y su ADN intergenico es muy pequeño, sin embargo en los eucariontes  si presentan intrones y grandes cantidades de ADN intergenico.